微生物检测实训室建筑面积160 m2，包括普通微生物实验室、培养室、无菌室，设备总值106.58万元，主要包括超净工作台、生物洁净台、拍击式均质器、光照培养箱、生化培养箱、立式震荡培养箱、电热恒温鼓风干燥箱、电热恒温鼓风干燥箱、冰箱、超低温冰箱、阿贝折射仪、数显折光仪、大容量恒温振荡器、水浴恒温振荡器、臭氧空气净化机、立式压力蒸汽灭菌器、水浴恒温振荡器、电子天平等以及微生物常规玻璃仪器等，拥有较完善的教学设施和优秀的教师队伍。
目前微生物实验室开设的实验课有《食品微生物学》、《食品微生物检验技术》、《水产品微生物学》等课程，主要实训项目包括细菌的形态观察、放线菌的形态观察、霉菌的形态观察、酵母菌的形态观察及测微技术、培养基的配制及高压蒸汽灭菌技术、微生物生理生化反应、微生物的分离和纯化技术、环境因素对微生物生长发育的影响、饮用水中细菌总数及大肠菌群的检测、食品中细菌总数测定等微生物基础实验，以及食品中大肠杆菌、金黄色葡萄球菌、志贺氏菌、沙门氏菌等项目的检测。
微生物实验室十分重视教学内容及教学方法的改革与创新。努力进行教学研究，建立了崭新的教育理念和育人观念。为提高学生的自主学习能力和创新能力等，既注重基础实验技能的训练，又强化综合素质的培养。在实验课教学中，教学方法多种多样，开展基础性实验、综合型与研究创新型实验相结合的教学内容以及开放性实验内容及创新项目，除了正常上课外，课外时间对学生开放，鼓励和吸引学生利用实验室优越条件开展学习活动。
